把信送出去以后，李三才就着急的等待着回信。可他注定要失望了，京城之内又发生了一件大事，让他嘱托的那位朋友竟然一时无法他顾，回信便忘到了脑后……
为了进一步在新军中打下自己的烙印，朱由校便专门抽出一天时间，主持了大明皇家军校第一批学员毕业暨新军成军典礼。
在典礼上，朱由校向毕业生们一一‘授兵’，把一柄尺半长的短剑授予他们，表明他们已经毕业，成为了大明的一位英勇军官。后来，这种礼节被延续下来，称为‘授兵礼’，成为了大明皇家军校的传统，每批学生毕业时，便由校方奏请皇帝，由皇帝或皇储亲自出席并授兵。
授兵之后，便是给这些军官分配工作了。可就是这时，朱由校却发现了一个问题，参加检阅的新军士兵有点不对劲。
按照当初的规划，这次参加检阅的新军有三千人，都是直隶新军练兵大使郭巩刚刚训练出来的。在这次典礼上，朱由校将亲自把新毕业的二百名军官分配到新军中，让他们成为基层军官，然后宣布成军。
可是，朱由校却突然发现，这批新兵站姿松松垮垮的，毫无半点军人气概不说，穿的衣服也很新，一看都是才发下去的。
“黄嘉善，”朱由校惊怒之下，就大声把兵部尚书喊了过来。
“臣在，”猛不丁听皇上喊了一嗓子，兵部尚书黄嘉善有点摸不着头脑，但也不敢怠慢，连忙向前一步，躬身施礼，“陛下有何吩咐。”
朱由校抬头看了看四周，发现除了这手无寸铁的三千新兵外，其他的都是随自己来的御马监兵马，正在小心拱卫，这才放下心来。低头呵斥道：“黄嘉善，你竟敢欺君？”
“啊，”黄嘉善的脸顿时就白了，其他人也是个个目瞪口呆。过了半晌，黄嘉善才醒悟过来，“陛下，陈冤枉啊，臣不敢欺君……”
“你还敢狡辩？”朱由校更是气不打一处来，用手指了指新军兵卒，“……这些士兵的衣服是何时发的？”
黄嘉善随着皇上的手指回头向新军看去，却并没有发现什么异常，便犹豫道：“新兵入营时，发了两身衣服，除此以外，并没有发过。”
“你确定？”朱由校阴森森的笑了，“不是你为了拍朕的马匹，今日才发的？”
“不是，”黄嘉善还摸不清头脑，见皇帝质疑自己，便叫起冤枉来。“……兵部买根针线，都要去户部报账。这么大的一批兵甲，臣哪来的钱啊？！”
“不是就好。”朱由校听了黄嘉善的话，也相信了，可也更加肯定自己的另一个判断，也顾不得和黄嘉善多说，直接吩咐身边的侍卫，“来两个嗓门大的，帮朕喊话……”
朱由校站在高高的点将台上，面对着那三千新兵，大声喊道：“新军将士们，听朕口令，预备……”
身边的几个大嗓门侍卫，忙大声把皇上的口令传了下去。随驾来的文武百官不知就里，傻着眼在那里看着，却见新兵队伍里一阵骚动，却随即平静下来……
“立正，”朱由校大声喊道，侍卫们连忙齐声高喊，‘立正……’
“向左转，”朱由校又发出了一句号令，结果大操场里‘轰’的一声，都大笑起来。原来，那三千新兵听了口令后，有的向左，有的向右，有的还愣着不动……，真是洋相百出，令人捧腹。
朱由校黑着脸，接着又发出一连串口令，那些新兵更是乱成一团，完全不知道所谓号令。朱由校再也忍耐不下去了，将手中的传令旗狠狠的砸在黄嘉善脸上，‘这就是你给朕联的新兵？……’
黄嘉善这才反应过来，跪在地上大声告饶，“陛下，臣冤枉啊。陛下，你听臣解释啊……”
朱由校却懒得理他，因担心自己孤悬城外，害怕有变。便叫过军校校长、英国公张维贤，让他主持着，把那些才毕业的军校生分派到新兵中控制军队；又留下魏忠贤、骆思恭在这里详查缘由；自己却带着文武大臣，在御马监掌印太监刘朝的护卫下，迅速返回宫中……
在厂卫的通力合作下，真相很快大白。原来，新兵练兵大使郭巩得到兵部命令后，不但不积极行动，训练兵卒。还驱逐士卒为奴，帮自己修缮宅院。当知道皇帝要亲临阅兵时，才草草的发下军服，让这些士卒排列成队，试图蒙混过关。可万万没想到，皇上几个简单的口令，就让真相暴露无遗……
朱由校看看后面，还有贪墨军饷等罪名，却也知道这是免不了的。想了想，便提笔在上面写了几个字，然后派人给内阁送去，让内阁照着票拟。
此时此刻，内阁值房早已挤满了人，北京城内够分量到这里来的，都挤了过来。方从哲等内阁阁臣一个个都是坐立不安，宰相城府也早抛之脑后。至于兵部尚书黄嘉善，更是脸色枯败、一脸落寞的坐在角落里。看到小黄门来了，黄嘉善猛的站起身来，却颤抖着手不敢向前，只是面带哀求的看着方从哲，委实让人心酸……
因今日的乱子实在太大，方从哲的心里也是七上八下的，有心想进宫面君，却被守门侍卫拦下，只好在这里和众人一起等候消息。如今，见中旨来了，方从哲哪还管得别人，抢先几步接过中旨，打开一看，心顿时便放了下来，原来，皇上在上面只批了九个字，‘黄嘉善失察，郭巩该死’……
“诸位，皇上仁慈，不愿多加株连。”方从哲面带笑容，从容说道：“大家还是议上一议，拿个处罚的章程吧。”
虽然落了个失察的罪名，也免不了要罚俸降职。可黄嘉善还是笑呵呵的说道：“……黄某戴罪之身，还是先避让了好。”说罢，便退出置房，留下众人商议。
片刻之后，内阁商议妥当，便由方从哲、刘一燝两人进宫面圣，交由皇帝审阅。
“……郭巩仅仅是个斩立决吗？”朱由校看着手中的票拟有点不满。
方从哲一愣，悄悄的和刘一燝对视一眼，便向前回道：“启奏陛下，这郭巩玩忽职守，酿成大错，斩立决已是顶格处罚了。”
布料，听了方从哲这话，朱由校心中更是不悦，“玩忽职守？这就是内阁给郭巩定的罪名？”
“是。”方从哲、刘一燝不明皇上意思，只能硬着头皮奏道：“给郭巩定的是玩忽职守，给黄嘉善定的是失察。”
“国器私用是什么罪名？”朱由校有点不耐烦了，便直接问道。
‘什么？国器私用？’方从哲、刘一燝闻言，脸色顿时大变，这至少可是个大不敬之罪啊？难道皇上还要对郭巩家人下狠手不成？……
犹豫了再三，方从哲终于鼓起勇气，想向皇上问个明白，也好从中转圜，救下郭巩的家人“……不知道这国器私用是从何说起？”
“新军，就是朕的国器，”朱由校忿忿不平的答道：“一个小小的兵科给事中，就敢驱逐朕的军队为己效力，这不是国器私用是什么？！”
方从哲心中一凛，顿时想起皇上对军权的看重来，便不敢多说。刘一燝却不知其中奥妙，向前奏道：“……这统兵之人驱使兵将为奴仆实属平常之事，唯有这郭巩文人带兵，不知深浅，才会一股脑的全部撵去干活。如今，陛下欲依此把郭巩治罪，怕是会军心浮动啊。”
‘笑话’，朱由校心想，如不是知道这一切，我会死抓着郭巩不妨？
“爱卿不必再言，”朱由校一摆手，示意刘一燝不要再说，“如不是原本卫所兵卒尽数化为私人所有，朕又何必创办军校、训练新军？这郭巩必死无疑，不杀怎么正新军风气。”
“那依陛下之见，又该如何处置？”方从哲连忙问道。
“抄家，族诛，女子充为营妓，郭巩传首九边，以儆效尤。”朱由校干脆利索的宣布了一串词汇，却每一个都让方、刘二人心惊胆颤。
“陛下，这是不是有伤陛下仁慈之名啊？”方从哲犹豫了半天，才小声问道。
“那也比朕身死国灭好，”朱由校不客气的等了他一眼，呵斥道，“以前的朕可以不管，但新军中胆敢有贪墨军饷、驱兵为奴、乱我法纪者，均当严惩。”
“臣等遵旨。”方从哲和刘一燝相对无言，只好苦着脸答应下来。
“好了，”朱由校想了想，觉得还要给内阁点面子，好让他们帮自己干活，便大气的给了点甜头，“黄嘉善等人失察的处罚，就按照内阁票拟，罚俸一年吧。”
“臣等遵旨。”方从哲和刘一燝连忙应允了。心中也平静下来。看来，皇上针对的都是兵将，并没有向上追究的意思，这样就好……
两人一边心中乱七八糟的想着，一边向皇上告辞，准备去内阁把皇上的意图告诉其他人……